フランスの場合，3か月以上の滞在に発行される長期ビザを取得しても，3か月の滞在許可証しかもらえません．渡仏後にOFII（移民局）や県庁でスタンプをもらい，長期の滞在許可証（Tirte de sejour, Carte de sejour）として有効化する必要があります．（イギリスのビザは最初から2年間有効だったんですけどねぇ…）申請は滞在許可証が失効する2か月前からできます．
研究者ビザは，2016年11月から手続きが変わり，OFIIではなく県庁での手続きになりました．私の場合，2017年1月に渡仏したので，全く経験談が見つかりませんでした．わからないことに対するストレスがすごかったので，ここにその記録を残しておきます．
大事なポイントは，フランスに到着したら，書類がそろっていなくとも，直ちに申請の予約を入れることです．2か月後くらいの日程しか予約できません．予約には住所と電話番号が必要ですが，渡仏前にわかっていれば，渡仏前に予約してもいいと思います．
提出書類（基本コピーで大丈夫ですが，原本確認されるものもあります．）
・Visaのコピー（フランスのもの，イギリスのもの），入国スタンプのコピー
・パスポートのコピー
・戸籍謄本の翻訳のコピー（コピーってばれてないかも．出生証明書，結婚証明書として）
・3カ月分の電話代の請求書（3カ月以内のもの1枚でもいいかも）
・Attestation de residence（大家さんにもらったやつ）
・家賃の請求書
・写真35mm*45mmを3枚（口の開いた写真は却下された）
・Protocol d’accueilのコピー
・certificat de scolarite（在学証明書）
・大学との契約書のコピー
・修士号の学位証明書の仏語翻訳版のコピー（コピーってばれてないかも）
・妻のパスポートのコピー
予約の仕方（Seine-Maritimeの場合）
予約は県庁のページからしました．スクショを残しておきます．メールで送られてくる予約表は印刷して手元に残しましょう．申請に必要です．また，予約表に必要な書類のリストが挙げられていますが，このリストの他にも必要な書類があります．
個人情報入力
予約を有効化するためのメールが届くので，送られてきたリンクにとぶ
正式に予約完了
予約表は印刷しておきます．
実際の申請 （2017/04/14）
私の場合，滞在許可証の失効前に予約が取れませんでした．端的に言えば不法滞在です．不法滞在に該当する期間は，予約表とパスポートを持ち歩いていました（パスポートは元々必携ですが…）．また申請書類についても，いくらの印紙が必要かわからなかったので，買っていきませんでした．
セキュリティチェックを受けて県庁に入り，待合室でしていると，”……Rendez-vous……”と質問している職員の方がいたので，自分の予約表を見せたら連れていかれました．（本来は，アナウンスで名前を呼ばれた後，窓口に向かいます．）その後，窓口に案内されたので，予約表を見せて，あらかじめ準備しておいた書類を全部出しました．どの書類もコピーを提出しましたが，Protocol d’accueilと戸籍謄本の翻訳，大学との契約書は原本を見せるように言われたので，見せました．また，住居証明が有効かわからなかったので，とりあえずいろんな種類を持っていったところ，全部もってかれました（たぶん電話代の請求書だけでいいはず…）．
書類の確認が終わると，SMSを受信できる電話番号を聞かれました．受け取りの準備が終わったら，SMSで連絡が来るようです．職員の説明によると，4～6週間で連絡が来るとのことです．
おそらく書類さえしっかりしていれば，フランス語しゃべれなくても問題ありません（たぶん）．
（追記）
2017/05/19 SMSで発行の連絡がきました．申請からちょうど5週間でした．
2017/08/25 妻の滞在許可証の申請をしました．混んできているので，6～7週間かかると説明されました．[:]